香蕉枯萎病菌果胶甲基酯酶基因的克隆与生物信息学分析

• 作者: 王振中 董章勇
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 农学
• 关键词: 果胶甲基酯酶 香蕉枯萎病 香蕉枯萎病菌 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2012,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 111-115
• 分类号: S436.68
• 字数: 3766字
• 语种: 中文

摘要

旨在了解香蕉枯萎病菌(Fusarium oxysporum f.sp.cubense)4号生理小种(FOC4) PME基因序列特征,根据同源物种PME相关序列设计引物,利用PCR和RT-PCR技术,克隆FOC4序列基因和开放阅读框,命名为Foc4Pme.结果表明,所获得的PME基因均含有2个内舍子和3个外显子,990 bp的片段,编码329个氨基酸.预测编码蛋白有信号肽,具有1个功能位点,其分子质量和等电点分为34.894 8 kD和9.17,该蛋白为稳定存在的蛋白.该蛋白疏水性最大值为2.022,最小值为-2.156,大部分区域为亲水区.该基因编码的蛋白具有一定保守性,进化上与镰刀菌亲缘关系最近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	董章勇		26	115	7.0	10.0
3	王振中	华南农业大学植物病理生理学研究室	71	1059	17.0	30.0