河南粳稻品种SSR指纹图谱的构建及遗传差异分析

• 作者: 李俊周 赵全志 郭敏杰 韩迎春
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 关键词: 粳稻 指纹图谱 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2012,（12）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1378-1389
• 页数: 12页
• 字数: 5968字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2012.12.004

摘要

为了建立河南粳稻品种的DNA指纹图谱,了解河南粳稻种植品种的遗传多样性,本研究利用均匀分布于水稻(Oryza sativa L.)12条染色体的37对SSR引物,以河南1963～2010年间主要推广种植的37个粳稻(O.sativa L.ssp.japonica)品种为材料,进行简单序列重复(SSR)指纹图谱构建和遗传多样性分析.结果表明,33对引物具有特异多态性片段,共检测到1 14个等位基因,平均每位点3.53个等位基因；引物多态性频率为0.054～0.739.37个品种的遗传相似系数为0.627～0.992,平均为0.812.17个品种都至少具有1对SSR特征引物,其余20个品种的鉴定需要结合不同的SSR引物.利用19对核心SSR引物构建的指纹图谱能逐一区分出36个粳稻品种.采用非加权类平均法(UPGMA)进行聚类分析,在遗传相似系数0.710处可将37个品种分为2大类,河南选育品种基本都聚到同一大类群,表明河南推广的粳稻品种遗传基础狭窄.