玉米自交系产量和品质相关性状与简单重复序列(SSR)的关联分析

• 作者: 姚希勤 李伟忠 胡国华 许崇香 闵丽 陈庆山
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 关键词: 玉米 SSR 关联分析 连锁不平衡 群体结构
• 年，卷（期）: 2012,（12）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1369-1377
• 页数: 9页
• 字数: 5576字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2012.12.003

摘要

为寻找并确定控制玉米产量、品质的基因组区域,本研究利用64对核心SSR(simple sequence repeats)标记对257份玉米(Zea mays L.)自交系构成的群体进行基因分型,分析群体连锁不平衡位点、群体结构,在此基础上,采用TASSEL软件的GLM(general linear mode)程序对株高、穗位、生育期、穗长、穗行数、百粒重、脂肪含量、蛋白质含量和淀粉含量共9个性状的表型数据与标记进行回归分析,确定标记对表型的解释率.结果表明:(1)在公共图谱上的SSR位点组合都有一定程度连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD),P＜0.01时,LD成对位点占总位点组合20.29％,D’＞0.5成对位点比例为12.65％.(2)SSR数据遗传结构分析表明,群体可分为5个亚群.(3)共鉴定出26个标记位点与9个性状相关联,大多集中在4、6、7和10染色体上,其中第7染色体上标记最多,为5个.8个位点的变异分别与株高、穗位、生育期、穗长、穗行数和蛋白质含量等6个表型性状极显著相关(P＜0.01),分别为umc1294作用于株高,对表型的解释率为7.2％;umc1741及phil 16作用于穗位,对表型的解释率为11.37％和8.57％; phi328175及phi260485作用于生育期,对表型的解释率为4.74％和5.6％; umc1741作用于穗长,对表型的解释率为5.77％;umc1309作用于穗行数,对表型的解释率为6.68％; bnlg1450及bnlg1185作用于蛋白质含量,对表型的解释率为9.41％和9.81％；其他18个标记与9个性状显著相关(P＜0.05).与单个性状关联的标记数目为1～7个,解释率为4.74％～14.31％.与产量相关性状关联的位点(次)累计为30个,与品质相关性状关联的位点(次)累计为7个,位点数目上品质性状远少于产量性状.部分标记与多个性状关联,可能是性状相关或一因多效的遗传基础,一些标记同时与某性状关联,多数标记与定位于遗传图谱的QTL(quantitative trait loci)一致,也有互补性.研究结果表明,这些位点及其区域内存在很多与产量、品质等性状相关的QTL,对提高玉米产量、改善玉米品质可能起到重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	胡国华		57	630	14.0	23.0
3	陈庆山		101	1391	21.0	33.0
4	许崇香		24	94	6.0	9.0
5	闵丽		22	113	7.0	10.0
6	李伟忠		20	61	5.0	7.0
7	姚希勤		7	15	2.0	3.0