香石竹斑驳病毒(CarMV)主要基因的分子变异分析

• 作者: 佟爱仔 孔宝华 李晓鹏 王连春 胡中会 蔡红 陈海如
• 来源期刊: 植物病理学报
• 学科: 农学
• 关键词: 香石竹斑驳病毒 p7 p9 CP 分子变异
• 年，卷（期）: 2012,（1）
• 所属期刊栏目: 细胞生物学、生理学、生物化学、分子生物学
• 页码范围: 17-24
• 分类号: S436.8
• 字数: 4066字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0412-0914.2012.01.003

摘要

香石竹斑驳病毒(Carnation mottle virus,CarMV)是侵染香石竹的主要病毒之一.本试验从12个香石竹品种中获得CarMV分离物,通过RT-PCR扩增包含p7、p9、CP3个主要基因的片段,并对扩增产物进行克隆测序.通过序列比对发现CarMV的p7、p9、CP 3个基因有较高的稳定性,p7基因核苷酸序列相似性为98.10％,氨基酸序列相似性为97.81％,其中氨基酸的第11和14位存在显著差异；p9基因核苷酸序列的相似性为98.80％,氨基酸序列相似性为99.13％,氨基酸序列在第4位差异明显；CP基因核酸序列相似性为97.58％,氨基酸的相似性为98.43％,氨基酸序列的第164和331位的变异存在相关性,整个CP变异位点比较分散.证实p7和p9的变异位点主要集中在暴露与寄主互作相关的N端,推测这是导致病毒变异,与寄主互作变异的重要位点.