牙鲆遗传作图及生长性状QTL定位

• 作者: 宋文涛 廖小林 牛余泽 王磊 赵永伟 陈松林 高峰涛
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 牙鲆 微卫星 生长性状 QTL定位
• 年，卷（期）: 2012,（11）
• 页码范围: 1640-1649
• 分类号: Q785|S917.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1231.2012.28025

摘要

采用牙鲆日本群体和韩国群体杂交的92个F1个体作为分离群体,利用微卫星标记和Joinmap 4.0作图软件构建了牙鲆遗传连锁图谱.共有221个SSR标记用于连锁图谱构建,雌性图谱中,共178个微卫星标记定位到22个连锁群上,观测总长度为(Goa)599.0 cM,覆盖率(Coa)达76.27％.雄性图谱中,共194个微卫星标记定位到23个连锁群上,Goa为693.4cM,Coa为78.82％.对全长、体质量、体高3组数据进行主成分分析处理,得到可解释3个性状的89.6％特征的一组数据,命名为牙鲆生长性状GT.用WinQTLCart 2.5软件的复合区间作图,在已构建的遗传连锁图谱上对牙鲆生长性状GT进行QTL定位,取LOD经验值2.5为QTL存在的阈值；对微卫星标记进行性状—标记之间的回归分析.本研究共定位3个与牙鲆生长性状GT相关的QTLs,qGT-f4 qGT-m20 qGT-f20,可解释表型变异率分别为27.60％,13.74％,10.27％.在性状—标记之间的回归分析中,得到22个与生长性状GT相关(P＜0.05)的微卫星标记,单个标记可解释表型变异率介于3.70％～10.42％,其中6个微卫星标记scaffold558_ 51720、scaffold558_26183、scaffold903_69232、scaffold485_47120、scaffold1262_ 77386、scaffold809_65154与生长性状GT之间呈极显著相关(P＜0.01),可解释表型变异率分别为10.42％、7.31％、10.07％、10.07％、8.39％和11.26％.