应用功能化氧化硅泡沫负载甲基化结合结构域建立一种富集甲基化DNA的方法

• 作者: 屠波 赵东元 陈雅婷 韩路 马端
• 来源期刊: 中华医学遗传学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 甲基化结合结构域 甲基化DNA 功能化氧化硅泡沫 富集
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 284-288
• 分类号: R730.231
• 字数: 4459字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.1003-9406.2012.03.008

摘要

目的 用功能化氧化硅泡沫负载甲基化CpG结合域(methyl-CpG binding domain,MBD)建立一种用于大样本初筛时富集甲基化DNA的方法.方法 将具有超大介孔尺寸的氧化硅泡沫(mesocellular silica foam,MCF)功能化并负载融合蛋白GST-MBD以结合甲基化DNA.结果 MCF功能化后仍保持较大的笼状孔结构,孔径约为55 nm,窗口约30 nm,空隙容积高达1.0 m3/g,MBD蛋白负载量达53 wt％.具有较高的结合甲基化DNA的活性和稳定性.在缓冲液盐浓度为500～550 mmol/L时,MCF-MBD能较为专一地区分并富集混合溶液中的甲基化DNA.结论 该方法为高通量和自动化检测DNA甲基化提供了一个较好的选择和分子生物学依据,为临床应用和DNA甲基化相关疾病的研究奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵东元	复旦大学上海医学院化学系	40	677	12.0	25.0
2	马端	复旦大学上海医学院分子医学教育部重点实验室	52	328	10.0	16.0
3	屠波	复旦大学上海医学院化学系	8	143	5.0	8.0
4	韩路	复旦大学上海医学院化学系	2	1	1.0	1.0
5	陈雅婷	复旦大学上海医学院分子医学教育部重点实验室	1	0	0.0	0.0