基于16S rDNA序列的帘蛤科贝类分子系统发育研究

• 作者: 周旻纯 孟学平 彭永兴 易乐飞 申欣 程汉良 董志国 陈冬勤
• 来源期刊: 水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 帘蛤科 线粒体DNA 16S rDNA 系统发育
• 年，卷（期）: 2012,（11）
• 所属期刊栏目: 研究与应用
• 页码范围: 657-662
• 页数: 6页
• 分类号: S917.4
• 字数: 4815字
• 语种: 中文

摘要

对21种帘蛤科贝类线粒体16S rRNA基因片段的核苷酸序列进行了分析,以探讨这一序列在种质鉴定、分子系统发育研究中的应用价值.试验结果表明,所有物种扩增片段长度504～642 bp,具有明显的长度多态性,序列A+T含量59.2％～69.0％,明显高于GC含量.物种间共有变异位点447个,其中简约信息位点351个.以16S rDNA片段序列为标记,以中国蛤蜊做外群,构建了帘蛤科贝类的系统发生树,拓扑结构显示,帘蛤科贝类形成3个明显类群,缀锦蛤亚科的13个种形成一个单系群,其结点自展值为93％.第二类群由雪蛤亚科、帘蛤亚科和镜蛤亚科的种类组成,结点自展值为87％.第三类群由仙女蛤亚科、青蛤亚科、楔形蛤亚科和文蛤亚科的种类组成,结点自展值为100％.结合拓扑结构分析和序列比对分析,本研究支持将短文蛤和丽文蛤订为文蛤的同物异名的观点,建议将丽文蛤和短文蛤订为文蛤的地理亚种;支持将薄片镜蛤和Dosinia angulosa订为2个独立种的观点;宜将波纹巴非蛤和织锦巴非蛤订为2个独立种.