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摘要:
[目的]本研究旨在分析典型虾塘养殖水体中参与氮循环关键过程的菌群多样性,为指导实际对虾养殖水体中NH4+和NO2-的微生物降解、水体氮素污染控制以及虾塘养殖氮素循环的有效管理提供科学依据.[方法]使用聚合酶链式反应及变性梯度凝胶电泳技术(Polymerase Chain Reaction-Denaturing Gradient Gel Electrophoresis,PCR-DGGE)从8个不同地点的虾塘水样中确定代表性水样,以此为典型水样进行研究,构建了氨单加氧酶基因( amoA)、亚硝酸盐氧化还原酶基因(nxrA)、亚硝酸盐还原酶基因(nirS)的克隆文库.利用限制性片段长度多态性(Restriction Fragment Length Polymorphism,RFLP)技术将克隆文库进行酶切分析.[结果]通过序列多态性分析,表明amoA基因克隆文库中所有序列都属于变形杆菌门β亚纲(β-Proteobacteria),分别为亚硝化单细胞菌属(Nitrosomonas)(81%)和亚硝化螺旋菌属(Nitrosospira)(19%)2个属.nxrA基因克隆文库检测到α-Proteobacteria和δ-Proteobacteria两个亚纲,其中硝化杆菌属(Nitrobacter)是优势菌群,占整个文库的92%,仅有一个类群属于δ亚纲的脱硫杆菌科(Desulfobacteraceae)(8%).nirS基因文库群落结构相对于amoA和nxrA基因文库较复杂,分别为α-Proteobacteria、β-Proteobacteria亚纲和Actinobacteria,序列分析表明,25%的类群为固氮弧菌属(Azoarcus),25%的类群为(Polymorphum),20%的类群为需氧去氮菌属(Thauera),10%的类群为(Sophophora),10%的的类群为链霉菌属(Streptomyces),5%的类群为(Brachymonas),5%的类群为(Ruegeria).[结论]典型虾塘养殖水环境中氮素循环关键过程的菌群多样性丰富,其中亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)和硝化杆菌属(Nitrobacter)分别是此环境中主要的氨氧化作用推动者和亚硝酸盐氧化作用推动者,而在反硝化重要环节中,固氮弧菌属等多种菌群都起着推动作用.
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内容分析
关键词云
关键词热度
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文献信息
篇名 典型对虾养殖水体中参与硝化与反硝化过程的微生物群落结构
来源期刊 微生物学报 学科 生物学
关键词 PCR-DGGE 氨单加氧酶基因(amoA) 亚硝酸盐氧化还原酶基因(nxrA) 亚硝酸盐还原酶基因(nirS) 克隆文库 系统发育树
年,卷(期) 2012,(4) 所属期刊栏目 生态和环境微生物
研究方向 页码范围 478-488
页数 分类号 Q938
字数 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 林炜铁 华南理工大学生物科学与工程学院 70 1267 22.0 33.0
2 李敬源 华南理工大学生物科学与工程学院 3 34 3.0 3.0
3 罗剑飞 华南理工大学生物科学与工程学院 18 150 7.0 12.0
4 田国梁 华南理工大学生物科学与工程学院 2 34 2.0 2.0
传播情况
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氨单加氧酶基因(amoA)
亚硝酸盐氧化还原酶基因(nxrA)
亚硝酸盐还原酶基因(nirS)
克隆文库
系统发育树
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
微生物学报
月刊
0001-6209
11-1995/Q
大16开
北京朝阳区北辰西路1号中科院微生物所内
2-504
1953
chi
出版文献量(篇)
4459
总下载数(次)
15
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
论文1v1指导