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辽宁省2008~2011年流行性腮腺炎野病毒SH蛋白基因特征分析
辽宁省2008~2011年流行性腮腺炎野病毒SH蛋白基因特征分析
作者:
王艳
郭军巧
韩悦
马艳
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
流行性腮腺炎野病毒
SH蛋白
基因特征
基因型
摘要:
本研究用Vero/Slam细胞从辽宁省2008~2011年流行性腮腺炎暴发和散发患者的临床标本中分离到13株流行性腮腺炎野病毒(Mumps virus,MuV),应用逆转录聚合酶链反应(RT- PCR)针对MuV分离株的SH基因的316个核苷酸片段进行扩增,并对该产物进行序列测定.将这13株MuV与从GenBank下载的世界卫生组织(WHO)MuV基因型参考株一起进行分子流行病学研究.结果提示:除2011-015株外,辽宁省2008~2011年12株MuV分离株均属于F基因型,核苷酸和氨基酸同源性为94.9%~100%和83.3%~100%.与F基因型参考株序列相比,核苷酸和氨基酸同源性分别为92.4%~97.2%和96.5%~84.2%.表明2008~2011年辽宁省流行的F基因型MuV发生较大的型内变异.另外还发现F基因型MuV在SH基因上存在着特异性突变(CNt65,C Nt105,G Nt137,C Nt192,C Nt239,GNT262),而其它基因型MuV在这些位点上均未发生改变.F基因型MuV在SH基因编码的氨基酸保守位点也发生变化.如:第2位上由S→P,第6位上由P→L,第23位上由T→N,第48位上由L→P/R.与基因分型有关的氨基酸三联体,2008-01-007毒株也发生了改变,由IML变为TMP.2011-015株病毒与F基因型参考株平均核苷酸和氨基酸同源性分别为87.5%和79.8%,与G型参考株平均核苷酸和氨基酸同源性分别为96.8%和97.4%,属于G基因型.该基因型为中国内地首次发现.
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篇名
辽宁省2008~2011年流行性腮腺炎野病毒SH蛋白基因特征分析
来源期刊
病毒学报
学科
医学
关键词
流行性腮腺炎野病毒
SH蛋白
基因特征
基因型
年,卷(期)
2012,(5)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
506-510
页数
5页
分类号
R373.16
字数
语种
中文
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SH蛋白
基因特征
基因型
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研究去脉
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病毒学报
主办单位:
中国微生物学会
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-8721
CN:
11-1865/R
开本:
大16开
出版地:
北京西城区迎新街100号
邮发代号:
82-227
创刊时间:
1985
语种:
chi
出版文献量(篇)
2313
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