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两种色型黄粉虫抗冻蛋白cDNA克隆、序列分析与表达分析
两种色型黄粉虫抗冻蛋白cDNA克隆、序列分析与表达分析
作者:
周定刚
朱天辉
杨伟
王勤
胡杰
黄琼
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
黄粉虫
色型
抗冻蛋白
基因异构体
序列分析
mRNA表达
摘要:
产生抗冻蛋白(antifreeze proteins,AFPs)是大多数昆虫抵抗低温的一个重要策略.为给黄粉虫Tenebrio molitotr耐寒机理研究提供参考,本研究采用RT-PCR、5′RACE和3′RACE法克隆了黄、黑两种色型黄粉虫幼虫的抗冻蛋白基因Tm-afp,分析了其基因序列及所编码的氨基酸序列,并检测了其在这两种色型间的mRNA水平差异.结果表明:从黄、黑两种色型黄粉虫幼虫克隆出的Tm-afp cDNA全长分别为579 bp和588 bp,它们包含一个20 bp的5′端非翻译区、一个402 hp的开放阅读框和一个变异较大的3′端非翻译区,其碱基序列一致性为95%.由于这两个抗冻蛋白基因编码的蛋白成熟肽存在两个氨基酸差异:第35位(D→E)和130位(T→S),因此将其判定为黄粉虫抗冻蛋白基因Tm-afp的两个异构体,并分别命名为Tm-afp-1和Tm-afp-2.Tm-afp-1和Tm-afp-2编码的抗冻蛋白异构体(分别为Tm-afp-1和Tm-afp-2)信号肽之间有3个氨基酸差异:第2位(G→A)、9位(S→T)和27位(Y→N);其成熟肽的第一个氨基酸为谷氨酰胺,含8个高度保守的12aa短串联重复序列,每个重复序列的第2位和第8位为半胱氨酸.此外,Tm-afp-1和Tm-afp-2均属富含苏氨酸和半胱氨酸的昆虫抗冻蛋白,其二级结构均由大量的β-折叠和无规则卷曲组成,三级结构为8个特殊的右手β-螺旋,每一圈螺旋由12个氨基酸组成;在β-螺旋的一个侧面规则排列着由保守XCT形成的β折叠片层.同时,低温可以诱导黄、黑两种色型黄粉虫Tm-afp的表达,但长时间低温诱导下黑色型黄粉虫幼虫的Tm-afp表达量显著高于黄色型黄粉虫幼虫Tm-afp表达量.结果提示,黄粉虫种内不同色型间,抗冻蛋白基因Tm-afp可能存在多种异构体,并且黑色型黄粉虫Tm-afp比黄色型黄粉虫Tm-afp对低温的应答更强烈.这一研究结果为进一步探索黄粉虫的耐寒性机理提供了有益参考.
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文献信息
篇名
两种色型黄粉虫抗冻蛋白cDNA克隆、序列分析与表达分析
来源期刊
昆虫学报
学科
生物学
关键词
黄粉虫
色型
抗冻蛋白
基因异构体
序列分析
mRNA表达
年,卷(期)
2012,(6)
所属期刊栏目
生理与生化
研究方向
页码范围
659-667
页数
分类号
Q969.97
字数
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
朱天辉
167
1369
19.0
26.0
2
周定刚
四川农业大学动物科技学院
55
494
13.0
18.0
3
杨伟
四川农业大学森林保护学省级重点实验室
91
969
16.0
25.0
7
黄琼
四川农业大学森林保护学省级重点实验室
32
391
13.0
18.0
11
胡杰
四川农业大学经济管理学院
17
190
8.0
13.0
12
王勤
四川农业大学生命科学与理学院生物系
17
144
5.0
12.0
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
(203)
共引文献
(48)
参考文献
(17)
节点文献
引证文献
(5)
同被引文献
(9)
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抗冻蛋白
基因异构体
序列分析
mRNA表达
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
昆虫学报
主办单位:
中国科学院动物研究所
中国昆虫学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0454-6296
CN:
11-1832/Q
开本:
16开
出版地:
北京市朝阳区北辰西路1号院5号中国科学院动物研究所
邮发代号:
创刊时间:
1950
语种:
chi
出版文献量(篇)
3602
总下载数(次)
9
总被引数(次)
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