烟草可培养内生细菌16S rDNA的PCR-RFLP和系统发育分析

• 作者: 夏振远 陈泽斌 陈海如 雷丽萍
• 来源期刊: 中国烟草学报
• 学科: 工学
• 关键词: 烟草 可培养 内生细菌 RFLP
• 年，卷（期）: 2012,（1）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 92-100,105
• 分类号: TS414
• 字数: 6389字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-5708.2012.01.016

摘要

为了解烟草内生细菌的多样性,采用改良的NA培养基和稀释平板法从不同生长期的烟草的根、茎、叶中分离得到127株内生细菌.利用细菌16S rDNA特异引物扩增得到16S rDNA的部分片段,长约700 bp,分别用内切酶MspⅠ、HaeⅢ、AfaⅠ、HinfⅠ对扩增产物进行限制性酶切.16S rDNA PCR-RFLP分析中,在100％相似性水平处,除了cj23、ty16、cg23、wy6、cj25、wy13、my23、ty7、cj14、cg25、cg2、cj13、my11,my27单独成群外,其余菌株分为15个分类操作单元,其中Otu1、Otu2,Otu27类群最大,分别包括了27、18,26个菌株.对29个代表菌株16S rDNA序列系统发育分析表明,这些菌株主要分布于芽孢杆菌(Bacillus)分支,其余菌株分布于葡萄球菌属(Staphylococcus)、微杆菌属(Microbacterium)、单胞菌属(Sphingomonas)、中华根瘤菌属(Sinorhizobium)、土壤杆菌属(Agrobacterium)、根瘤菌属(Rhizobium)、纳西杆菌属(Naxibacter)、贪铜菌属(Cupriavidus)、寡养食单胞菌属(Stenotrophomonas)、不动杆菌属(Acinetobacter)、假单胞菌属(Pseudomonas)、肠杆菌属(Enterobacter)、泛菌属(Pantoea)、克雷伯菌属(Klebsiella)、Bifissio属系统发育分支.通过Shannon多样性指数对不同生长期分离到的菌株进行多样性分析和比较,结果表明团棵期叶片中分离到的内生细菌多样性最大,随后是旺长期,苗期次之,成熟期最小.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	雷丽萍		64	598	15.0	21.0
2	夏振远		67	689	15.0	23.0
3	陈海如	云南农业大学植物保护学院	117	990	16.0	23.0
4	陈泽斌	云南农业大学植物保护学院	9	108	7.0	9.0