六种甘蓝自交不亲和雄性决定因子部分cDNA的克隆及序列分析

• 作者: 余浩 孙海燕 张贺翠 朱利泉 杨昆 王小佳 罗兵 薛丽琰
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甘蓝 自交不亲和 雄性决定因子 cDNA克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2012,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 616-626
• 分类号: S635
• 字数: 7848字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2012.06.004

摘要

S-富含半胱氨酸蛋白(SCR)是自交不亲和雄性决定因子,为了比较甘蓝不同S单倍型SCR基因结构和蛋白分子特性,依据mRNA的ployA序列和SCR保守氨基酸序列设计引物,利用巢式PCR技术分别获得了6种甘蓝(Brassica oleracea L.)D3、E1、240、A1、N1和G1的SCR基因的部分cDNA序列,均包含3UTR.生物信息学分析表明,6条cDNA序列长度分别为319、311、290、288、385和377bp,分别编码1个58、58、58、58、58和55个氨基酸的SCR蛋白,其中D3的SCR与SCR3序列一致,甘蓝E1、240、Al和N1的SCR与SCR7序列一致,而甘蓝G1的SCR为一个新的S单倍型基因.研究表明,不同S单倍型的SCR二级结构和三维结构都有差异,其与S-位点受体激酶(SRK)相互作用的氨基酸在SCR分子表面,富含碱性氨基酸,且SRK-SCR相互作用需要静电荷参与.同时研究还表明,甘蓝自交不亲和性强度多样性,除了SCR和SRK本身作用能力因素以外,还与SCR和SRK分子的数量有关,而SCR的数量是通过3UTR在mRNA水平调控的.分析表明,SCR的进化速度很快,并且3'UTR的进化速度高于氨基酸编码区的进化速度.本研究为进一步探索和利用自交不亲和机制提供了理论基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	朱利泉	西南大学植物生理生物化学实验室	66	505	13.0	19.0
2	罗兵	西南大学植物生理生物化学实验室	31	126	7.0	10.0
4	孙海燕		32	127	7.0	10.0
5	杨昆	西南大学植物生理生物化学实验室	27	125	7.0	10.0
8	薛丽琰	西南大学植物生理生物化学实验室	3	6	2.0	2.0
9	张贺翠	西南大学植物生理生物化学实验室	18	41	3.0	5.0
10	余浩	西南大学植物生理生物化学实验室	4	5	1.0	2.0