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基因芯片检测结核分枝杆菌利福平异烟肼耐药性的应用评价
基因芯片检测结核分枝杆菌利福平异烟肼耐药性的应用评价
作者:
刘小立
崔运勇
桂静
王峰
赵广录
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
分枝杆菌,结核
抗药性,细菌
利福平
异烟肼
寡核苷酸序列分析
摘要:
目的 评价基因芯片检测结核分枝杆菌临床株对利福平和异烟肼耐药性的效果,探讨耐多药结核分枝杆菌基因检测合适的靶位点.方法 回顾性收集深圳市慢性病防治中心2009年门诊患者痰标本菌株24株及2007至2009年深圳市耐药监测项目痰标本培养分离菌株127株.采用基因芯片检测其对利福平和异烟肼耐药性,与比例法药敏试验结果比较,评价其敏感度、特异度和准确性.Kappa检验评价芯片检测和表型药敏结果的一致性.对结核分枝杆菌利福平、异烟肼主要耐药相关基因rpoB、katG、inhA编码区、inhA启动子区和ahpC启动子区测序,分析耐药相关突变位点及频率.结果 基因芯片检测利福平耐药的敏感度为94.4%,特异度为97.5%,准确性为96.0%;检测异烟肼耐药的敏感度为79.1%,特异度为100%,准确性为86.8%.耐利福平菌株中97.2% (70/72)在rpoB突变热点区域发生突变,位点包括531、526、516、511和533位密码子.耐异烟肼菌株中,70.3% (64/91)发生katG315密码子突变,11.0%(10/91)发生inhA-15突变,还有9株(9.9%)在ahpC启动子区发生突变,包括ahpC-9(4株)、ahpC-10(2株)、ahpC-6(2株)、ahpC-12(1株)和ahpC-32(1株).结论 基因芯片系统可以快速检测结核分枝杆菌对利福平和异烟肼耐药性,对利福平的检测具有良好的敏感度和特异度,检测异烟肼敏感度稍低.ahpC启动子区可以作为异烟肼耐药突变检测靶基因,联合筛选katG315密码子、inhA-15和ahpC启动子区突变可以显著提高异烟肼耐药性检测敏感度.
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篇名
基因芯片检测结核分枝杆菌利福平异烟肼耐药性的应用评价
来源期刊
中华检验医学杂志
学科
关键词
分枝杆菌,结核
抗药性,细菌
利福平
异烟肼
寡核苷酸序列分析
年,卷(期)
2012,(12)
所属期刊栏目
论著
研究方向
页码范围
1125-1129
页数
5页
分类号
字数
4822字
语种
中文
DOI
10.3760/cma.j.issn.1009-9158.2012.12.015
五维指标
作者信息
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姓名
单位
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刘小立
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桂静
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研究主题发展历程
节点文献
分枝杆菌,结核
抗药性,细菌
利福平
异烟肼
寡核苷酸序列分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中华检验医学杂志
主办单位:
中华医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1009-9158
CN:
11-4452/R
开本:
大16开
出版地:
北京市西城区宣武门东河沿街69号
邮发代号:
2-71
创刊时间:
1978
语种:
chi
出版文献量(篇)
7229
总下载数(次)
38
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