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小麦生长素结合基因TaABP1-D的克隆、功能标记开发及其与株高的关联
小麦生长素结合基因TaABP1-D的克隆、功能标记开发及其与株高的关联
作者:
乔麟轶**
张文萍
张磊**
王玺*
贾继增
赵光耀
原文服务方:
作物学报
小麦
TaABP1-D基因
同源克隆
表达分析
功能标记
相关性分析
摘要:
生长素在植物生长发育过程中通过建立浓度梯度来调控植物的株型.ABP1(auxin binding protein)作为生长素受体,在质膜上相关生长素响应活动中起重要作用.本研究从普通小麦中国春基因组数据库中分离了TaABP1基因的基因组序列,根据基因组间序列差异将 TaABP1定位于小麦第5同源群.在中国春中克隆得到 TaABP1-D基因的gDNA和cDNA序列.TaABP1-D基因的开放阅读框为1887 bp,编码205个氨基酸,含有ABP1蛋白典型的内质网滞留信号KDEL及Box区域.表达分析表明, TaABP1-D在普通小麦中国春拔节期的根、茎基部、茎上部和叶尖均有表达,相对表达量为叶尖>茎上部>根>茎基部,与小麦的株型发育关系密切.系统发育分析表明, ABP1基因在植物中较为保守, TaABP1-D是水稻OsABP1的直向同源基因.针对TaABP1-D基因上游调控区重复序列差异(GT)6/5开发了一个 SSR标记,该标记在 W7984×Opata85重组自交系(RIL)群体中对株高的表型变异解释率为9.7%,是一个与株高极显著关联的功能标记;其中对应高秆类型的等位变异属野生种特有,在栽培种中被淘汰,推测TaABP1-D基因在小麦驯化过程中可能经历了瓶颈效应.
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SNP标记
株高
全基因组关联分析
内容分析
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相关学者/机构
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期刊文献
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文献信息
篇名
小麦生长素结合基因TaABP1-D的克隆、功能标记开发及其与株高的关联
来源期刊
作物学报
学科
关键词
小麦
TaABP1-D基因
同源克隆
表达分析
功能标记
相关性分析
年,卷(期)
2012,(11)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
2034-2041
页数
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.3724/SP.J.1006.2012.02034
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
贾继增
中国农业科学院作物科学研究所/农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程/农业部作物基因资源与种质创制重点实验室
60
3975
33.0
60.0
2
张文萍
沈阳农业大学农学院
2
11
2.0
2.0
3
乔麟轶**
沈阳农业大学农学院
1
8
1.0
1.0
4
张磊**
沈阳农业大学农学院
1
8
1.0
1.0
5
王玺*
沈阳农业大学农学院
1
8
1.0
1.0
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版权信息
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同被引文献
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节点文献
小麦
TaABP1-D基因
同源克隆
表达分析
功能标记
相关性分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
作物学报
主办单位:
中国作物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0496-3490
CN:
11-1809/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1950-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
5614
总下载数(次)
0
总被引数(次)
197718
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