脊尾白虾3个野生群体ITS1序列分析及其亲缘关系分析

• 作者: 刘萍 李健 马朋
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 脊尾白虾 ITS1 遗传多样性 系统进化
• 年，卷（期）: 2012,（8）
• 页码范围: 1185-1192
• 分类号: Q347|S917.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1231.2012.27924

摘要

对脊尾白虾的莱州湾、海洲湾、象山湾3个野生群体共计62个个体的核糖体RNA转录单元内间隔区ITS1基因片段进行克隆和测序,对序列特点进行分析,并结合GenBank数据库中已有的长臂虾亚科ITS1同源序列虾类进行系统分析.结果显示,脊尾白虾的ITS1序列具有长度多态性,其长度为345～384 bp,62条序列GC的平均含量显著高于AT含量；共检测到79个变异位点,39种单倍型,多态位点比例为21.7％；海洲湾群体遗传多样性指数最高,象山湾群体次之,莱州湾群体最低.在脊尾白虾ITS1序列中发现微卫星序列共有8处,重复序列类型为(GC)n、(AG)n、(GGC)n、(GGA)n、(AT)n、(GA)n,以(GA)n类型最多.AMOVA分析结果显示3个群体间的遗传分化较弱或只有中度分化.另外用MEGA4.0软件中的NJ法构建分子进化树,探讨长臂虾亚科几个种的系统进化关系,系统树显示同种的不同个体、同属的不同种聚在一起,与形态学的分类吻合.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘萍	中国水产科学研究院黄海水产研究所	124	3043	33.0	48.0
2	李健	中国水产科学研究院黄海水产研究所	215	3950	34.0	49.0
3	马朋	中国水产科学研究院黄海水产研究所	2	14	2.0	2.0