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大鲵Dmrt2基因cDNA的克隆与表达分析
大鲵Dmrt2基因cDNA的克隆与表达分析
作者:
刘巧林
刘敏
周伟
姚一彬
肖真明
肖调义
许宝红
陈开健
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
大鲵
Dmrt2
实时荧光定量PCR
摘要:
Dmrt2是参与性腺发育最古老的发育基因家族Dmrt家族成员之一,在维持胚胎组织的正常发育、精子的发生、神经系统和感觉器官发育等方面起重要作用.目前在哺乳动物人类、鸟类红原鸡以及水生动物青鳉中都克隆到Dmrt家族成员并证明其与性腺和生长发育的密切相关性.研究采用RACE方法克隆了大鲵Dmrt2基因全长cDNA序列共2 026 bp,开放阅读框长1 581 bp,5’非编码区长58 bp,3’非编码区长387 bp,基因序列提交GenBank的登录号为FJ859987.该基因编码蛋白含526个氨基酸,依生物信息学方法预测该氨基酸为非跨膜蛋白,无信号肽,定位在细胞质内,无分泌蛋白.CDD数据库分析该ORF框翻译的氨基酸,在93~146位含DM保守结构域(c102557)的两个成员pfam00751和smart003010,与哺乳类人mab-3、鸟类红原鸡Dmrt2、两栖类非洲爪蟾Dmrt2和水生类鲐mab-3 DM结构域存在I(异亮氨酸)、R(精氨酸)、M(甲硫氨酸)、T(苏氨酸)、C(半胱氨酸)5个氨基酸的变异;系统进化树分析表明:大鲵Dmrt2与以上四物种首先聚类,据此推测Dmrt基因在进化上高度保守,DM结构域上5个氨基酸的变异对蛋白功能的发挥可能无重要影响.实时荧光定量组织差异表达显示,Dmrt2基因在大鲵的精巢和肌肉组织中高表达,预示该基因可能在性腺发育和生长发育方面起重要作用.
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文献信息
篇名
大鲵Dmrt2基因cDNA的克隆与表达分析
来源期刊
水产学报
学科
农学
关键词
大鲵
Dmrt2
实时荧光定量PCR
年,卷(期)
2012,(8)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
1179-1184
页数
分类号
Q785|S917.4
字数
语种
中文
DOI
10.3724/SP.J.1231.2012.27941
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
肖调义
湖南农业大学动物科学技术学院
178
1838
23.0
34.0
2
陈开健
湖南农业大学动物科学技术学院
50
581
12.0
23.0
3
刘敏
湖南农业大学动物科学技术学院
60
157
7.0
9.0
4
周伟
湖南农业大学动物科学技术学院
10
49
4.0
7.0
5
许宝红
湖南农业大学动物科学技术学院
37
164
7.0
10.0
6
刘巧林
湖南农业大学动物科学技术学院
31
154
7.0
10.0
7
肖真明
湖南农业大学动物科学技术学院
3
31
2.0
3.0
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
引文网络
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共引文献
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参考文献
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同被引文献
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大鲵
Dmrt2
实时荧光定量PCR
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研究来源
研究分支
研究去脉
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期刊影响力
水产学报
主办单位:
中国水产学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-0615
CN:
31-1283/S
开本:
大16开
出版地:
上海市临港新城沪城环路999号
邮发代号:
4-297
创刊时间:
1964
语种:
chi
出版文献量(篇)
3756
总下载数(次)
11
总被引数(次)
60406
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
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