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摘要:
前期研究基于中国荷斯坦牛女儿设计资源群体,采用Illumina公司Bovine50K微珠芯片对产奶性状进行了全基因组关联分析(GWAS),利用传递不平衡(L1-TDT)和回归分析(MMRA)2种统计分析方法共同检测到35个显著SNPs位点.本研究旨在基于该GWAS结果进一步对产奶性状基因进行鉴定及功能注释.基于牛基因组序列草图(Btau4.2),采用生物信息学和比较基因组学方法进行显著SNPs位置候选基因筛查和功能预测.分析发现,12个SNPs位点位于基因内部,23个位于基因侧翼,最终鉴定到28个位置候选基因,并确定了其物理位置、基因类型及潜在功能.基因功能可归纳为6种类型:调节机体营养成分代谢和平衡、细胞骨架或基质成分、调节细胞增殖和周期及凋亡、参与细胞信号转导和盐离子通道构成、具有激酶活性、参与mRNA转录调控或翻译调控.该研究为进一步鉴定中国荷斯坦牛产奶性状主效基因及功能验证打下了基础.
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文献信息
篇名 基于全基因组信息鉴定中国荷斯坦牛产奶性状基因及功能注释
来源期刊 畜牧兽医学报 学科 农学
关键词 中国荷斯坦牛 全基因组关联分析 产奶性状 功能注释
年,卷(期) 2012,(6) 所属期刊栏目 遗传繁育
研究方向 页码范围 872-877
页数 分类号 S823.91|Q38
字数 3448字 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 孙东晓 中国农业大学动物科技学院 55 606 16.0 22.0
2 张勤 中国农业大学动物科技学院 89 1003 18.0 29.0
3 张沅 中国农业大学动物科技学院 110 1282 19.0 28.0
4 刘剑锋 中国农业大学动物科技学院 24 196 8.0 13.0
5 齐超 中国农业大学动物科技学院 1 0 0.0 0.0
6 谢岩 中国农业大学动物科技学院 3 6 1.0 2.0
7 吴晓平 中国农业大学动物科技学院 3 4 1.0 2.0
8 姜力 中国农业大学动物科技学院 3 17 2.0 3.0
传播情况
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研究主题发展历程
节点文献
中国荷斯坦牛
全基因组关联分析
产奶性状
功能注释
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
畜牧兽医学报
月刊
0366-6964
11-1985/S
大16开
北京海淀区圆明园西路2号
82-453
1956
chi
出版文献量(篇)
5501
总下载数(次)
6
总被引数(次)
62883
相关基金
农业部“948”项目
英文译名:948
官方网址:http://www.stee.agri.gov.cn/xmjh/gzdt/t20040302_173683.htm
项目类型:种植业、畜牧业、渔业 、农业高、新技术、持续农业、设施农业、农产品采后处理与农业机械
学科类型:
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
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