尼罗罗非鱼MHC ⅡA基因的克隆、表达及多态性分析

• 作者: 傅咏 周芬娜 李同明 王慧 董忠典
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 尼罗罗非鱼 表达 多态性 基因 克隆 MHC
• 年，卷（期）: 2012,（8）
• 页码范围: 1167-1178
• 分类号: Q785|S917.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1231.2012.27903

摘要

为进一步了解鱼类MHCⅡA基因的特点及其在免疫反应中的功能,采用同源克隆、RACE-PCR、巢式PCR等技术,从健康的尼罗罗非鱼体获得1205 bp的MHCⅡA基因cDNA全序列(Orni-DBA-0101,Genebank登录号:JF719813)及1388 bp的基因组序列.序列分析发现,尼罗罗非鱼MHCⅡA基因含4个外显子和3个内含子,开放阅读框长720 bp,编码239个氨基酸.从4尾尼罗罗非鱼中共得到8条不同的cDNA序列,分别编码不同的氨基酸序列.氨基酸序列比对后发现,序列间存在丰富的多态性,且主要集中在α-1区,多态性位点数远远高于半滑舌鳎MHCⅡA基因.生物信息学分析表明,尼罗罗非鱼MHCⅡA编码的蛋白质分子包含1个信号肽、2个胞外结构域、1个跨膜区和1个胞质区,存在4个保守的半胱氨酸残基以及丰富的磷酸化位点,与其他物种的相似性为23％～65％.RT-PCR结果表明,MHCⅡA基因在脾、肾、肠、鳃、性腺、肝、心脏表达量很高,在鳔和肌肉中表达量最低.人工感染嗜水气单胞菌后,肝、脾、肾、鳃、肠5个组织中MHCⅡA基因的mRNA水平均发生了不同程度的变化,提示MHCⅡA分子作为一种重要的免疫因子,在清除病原的免疫反应中起着重要作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王慧	山东农业大学动物科技学院	141	1082	15.0	27.0
2	李同明	山东农业大学动物科技学院	10	17	3.0	3.0
3	董忠典	山东农业大学动物科技学院	5	26	3.0	5.0
4	周芬娜	山东农业大学动物科技学院	6	35	4.0	5.0
5	傅咏	山东农业大学动物科技学院	1	3	1.0	1.0