DNA甲基化的重要特征

• 作者: 张彦斌 戴国骏 戴胜冬 杨昆 王路路 胡三清
• 来源期刊: 生物物理学报
• 学科: 工学
• 关键词: DNA甲基化 CpG岛 特征选择 分类 支持向量机
• 年，卷（期）: 2012,（11）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 910-922
• 页数: 13页
• 分类号: Q6-33|TP391
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1260.2012.20077

摘要

目前,预测和分析DNA甲基化的研究所用的特征存在差异,缺少统一比较和评价,对非CpG岛序列缺少分析.为了进行统一比较和评价,作者集成DNA甲基化的主要特征,对CpG岛和非CpG岛序列进行分析,鉴别特征的重要性,并利用特征选择技术识别紧凑的特征子集.结果表明,序列模式和组蛋白修饰都是关联DNA序列甲基化的重要特征但并不独立,两者结合共同参与维持序列的甲基化模式；H3K4me3同时是CpG岛序列和非CpG岛序列最重要的组蛋白特征,具有最高的识别频率.本文标识DNA甲基化的重要特征在生物学上具有重要功能,可以作为线索来研究DNA甲基化、组蛋白修饰和基因调控间的关系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	戴国骏		47	456	12.0	20.0
2	胡三清		5	15	2.0	3.0
3	杨昆		8	10	2.0	2.0
4	戴胜冬		3	4	1.0	2.0
5	王路路		2	3	1.0	1.0
6	张彦斌		3	2	1.0	1.0