三种农田土壤中氨氧化细菌amoA基因多样性比较分析

• 作者: 丁玉芳 孙波 崔中利 曲浩丽 曹慧 汪峰
• 来源期刊: 土壤学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 氨氧化细菌 amoA基因 RFLP分析 农田土壤 微生物多样性
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 页码范围: 347-353
• 分类号: Q938
• 字数: 4624字
• 语种: 中文

摘要

比较分析中国东部不同季风气候区中海伦黑土(HL)、封丘潮土(FQ)和鹰潭红壤(YT)3种土壤氨氧化细菌amoA基因多样性.采用非培养方法直接从土壤中提取微生物总DNA,用氨氧化细菌amoA基因特异引物扩增总DNA,构建了3种土壤amoA基因文库,并对文库进行限制性长度多态性(RFLP)分析.HL、FQ和YT的amoA基因文库克隆数量分别为49、50和48个,相应的RFLP类型数为10、10和14个OTUs,其中有4个OTUs为三种土壤共有；YT中氨氧化细菌amoA基因多样性指数最高,FQ最低；HL和FQ群落的相似为70％,HL与YT的相似度为50％,而FQ和YT之间仅为42％,说明氨氧化细菌具有地理分布的规律:17个amoA基因序列可以被聚成6个cluster,分属Nitrosospira和Nitrosomonas两个属.三种农田土壤中均存在丰富的氨氧化细菌,表明氨氧化细菌在农田土壤氮素循环中具有重要作用.