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茶树品种福鼎大白茶和小雪芽叶片基因转录组研究
茶树品种福鼎大白茶和小雪芽叶片基因转录组研究
作者:
李娜娜
梁月荣
郑新强
陆建良
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
转录组
新梢白化
茶树参考基因库
SSR
基因表达
GO
COG
摘要:
以茶树品种福鼎大白茶和低温诱导型新梢白化茶树品种小雪芽叶片为材料,构建基因转录本;组装得到79797条茶树参考基因库(Unigene),其中,基因序列长度在1000 bp以上的有11371条,占Unigene库总数的14.25%.SSR分析显示,共有6439条SSR,其中1~3个碱基的完美重复SSR占84.32%.基因表达丰度RPKM 值显示,小雪芽表达上调的基因数为1821个,表达下调基因数为1779个.差异表达基因GO和COG分析显示,引起低温诱导型茶树新梢白化的可能遗传机理存在于蛋白质翻译后的修饰过程,而且这些变异主要发生在细胞内.
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内容分析
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相关文献总数
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(/年)
文献信息
篇名
茶树品种福鼎大白茶和小雪芽叶片基因转录组研究
来源期刊
江苏农业学报
学科
农学
关键词
转录组
新梢白化
茶树参考基因库
SSR
基因表达
GO
COG
年,卷(期)
2012,(5)
所属期刊栏目
遗传育种·耕作栽培·生理生化
研究方向
页码范围
974-978
页数
分类号
S571.9
字数
4121字
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
陆建良
浙江大学茶叶研究所
79
1652
25.0
38.0
2
梁月荣
浙江大学茶叶研究所
152
3087
31.0
45.0
3
郑新强
浙江大学茶叶研究所
25
245
10.0
14.0
4
李娜娜
浙江大学茶叶研究所
5
28
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2020(13)
引证文献(2)
二级引证文献(11)
研究主题发展历程
节点文献
转录组
新梢白化
茶树参考基因库
SSR
基因表达
GO
COG
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
江苏农业学报
主办单位:
江苏省农业科学院
出版周期:
双月刊
ISSN:
1000-4440
CN:
32-1213/S
开本:
大16开
出版地:
南京市孝陵卫钟灵街50号省农科院内
邮发代号:
28-113
创刊时间:
1985
语种:
chi
出版文献量(篇)
3989
总下载数(次)
8
总被引数(次)
36498
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