尾巨桉HMGR基因的克隆及表达分析

• 作者: 张华玲 彭江 蒋春
• 来源期刊: 广西植物
• 学科: 生物学
• 关键词: 尾巨桉 HMGR 生物信息学 内含子 组织特异性表达
• 年，卷（期）: 2012,（1）
• 所属期刊栏目: 植物生理学与分子生物学
• 页码范围: 113-117
• 分类号: Q943.2|Q946.85
• 字数: 3096字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-3142.2012.01.022

摘要

基于RACE技术克隆得到尾巨桉3-羟基-3-甲基戊二酰CoA还原酶(EuHMGR)基因全长为1 955bp,包含1 560 bp的开放阅读框(ORF),编码519个氨基酸.生物信息学分析表明EuHMGR包含两个HMG-CoA结合基序和两个NADP(H)结合基序；同源建模得到EuHMGR三维构象呈“V”型,包含N-结构域、S-结构域和L-结构域.将EuHMGR组DNA与cDNA序列进行比对表明Eu HMGR存在一个319 bp的内含子.通过实时定量PCR进行组织特异性表达分析表明EuHMGR在茎中的表达量最高,叶次之,在根中基本无表达.该研究为后续尾巨桉EuHMGR的功能验证以及遗传转化奠定基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	彭江	西南大学生命科学学院三峡库区生态环境教育部重点实验室	2	13	2.0	2.0
2	蒋春	四川大学生命科学学院生物资源与生态环境教育部重点实验室	4	19	3.0	4.0
3	张华玲	西南大学生命科学学院三峡库区生态环境教育部重点实验室	1	9	1.0	1.0