小黑麦碳酸酐酶蛋白质三维结构预测

• 作者: 任丽彤 何宣 孔广超 张晓磊 王白羽
• 来源期刊: 生物技术通报
• 学科: 农学
• 关键词: 小黑麦 碳酸酐酶 分子结构 结构预测 结构比对
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 151-158
• 分类号: S512.4
• 字数: 4796字
• 语种: 中文

摘要

根据已经克隆到的小黑麦碳酸酐酶基因序列,将其概念地翻译成蛋白质的氨基酸序列.利用MEGA4.1、DNAStarS.02、SOPMA、Swiss-Model Workspace和NCBI-VAST等在线软件和服务器对该小黑麦碳酸酐酶(CA)的一级结构、二级结构及三维结构进行了分子结构模型预测,并对其三维结构进行了比对.结果显示,小黑麦碳酸酐酶定位于线粒体内膜和叶绿体类囊体膜上,具有β类碳酸酐酶所特有的保守性基序C-[SA]-D-S-R-[LIVM]-x-[AP];SOPMA预测的二级结构显示,该酶含有α-螺旋(38.61％)、随机卷曲(54.44％)和β-折叠(6.95％).通过VAST矢量比对工具将小黑麦碳酸酐酶与模板(lekjA)三维结构进行比对,结果显示小黑麦碳酸酐酶与豌豆β碳酸酐酶同型八聚体中的一个单体( lekjA)具有很好的匹配,故推测小黑麦碳酸酐酶全酶也可能是同型八聚体.