以雾灵山夜蛾科为材料评估进化模型对DNA条码分类的影响

• 作者: 张爱兵 李俊 杨聪慧 武春生 迟美妍 金倩 陈付强 韩辉林 高强
• 来源期刊: 昆虫学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 鳞翅目 夜蛾科 COI基因 进化模型 DNA条形码 系统发育树 物种鉴定
• 年，卷（期）: 2012,（10）
• 所属期刊栏目: 进化与系统学
• 页码范围: 1193-1204
• 分类号: Q969
• 语种: 中文

摘要

为了探究进化模型对DNA条形码分类的影响,本研究以雾灵山夜蛾科44个种的标本为材料,获得COI基因序列.使用邻接法(neighbor-joining)、最大简约法(maximum parsimony)、最大似然法(maximum likelihood)以及贝叶斯法(Bayesian inference)构建系统发育树,并且对邻接法的12种模型、最大似然法的7种模型、贝叶斯法的2种模型进行模型成功率的评估.结果表明,邻接法的12种模型成功率相差不大,较稳定;最大似然法及贝叶斯法的不同模型成功率存在明显差异,不稳定;最大简约法不基于模型,成功率比较稳定.邻接法及最大似然法共有6种相同的模型,这6种模型在不同的方法中成功率存在差异.此外,分子数据中存在单个物种仅有一条序列的情况,显著降低了模型成功率,表明在DNA条形码研究中,每个物种需要有多个样本.