黑线仓鼠PPARβ部分编码区克隆与结构特征

• 作者: 徐来祥 徐金会 薛慧良 郑莹莹 陈蕾
• 来源期刊: 曲阜师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 黑线仓鼠 PPARβ 克隆 序列结构 系统进化 空间结构 锌指结构
• 年，卷（期）: 2012,（1）
• 页码范围: 85-90
• 分类号: Q74
• 字数: 3942字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-5337.2012.01.020

摘要

参考黑线仓鼠(Cricetulus barabensis)近缘种PPARβ的cDNA序列设计引物,采用RT-PCR法克隆得到黑线仓鼠PPARβ部分序列,并翻译成氨基酸.利用该结果与其他物种核苷酸及氨基酸序列进行相似性比较、构建系统进化树、一级结构分析、二级结构和空间结构预测.结果表明:得到的480 bp PPAR序列包括部分外显子4,全部外显子5、6及部分外显子7；共编码159个氨基酸；除人之外,黑线仓鼠PPARβ基因与其他物种的核苷酸相似性均在88％ -94％之间,氨基酸相似性均在90％以上；构建进化树得出,黑线仓鼠与鼠类亲缘关系最近,与人的亲缘关系最远；疏水性分析、二级结构预显示该编码区亲水性较强；二级结构、空间结构预测显示该序列含α螺旋较多；空间结构预测看出该段区域含两个典型的锌指结构.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	徐来祥	曲阜师范大学生命科学学院	95	654	12.0	22.0
2	薛慧良	曲阜师范大学生命科学学院	51	182	8.0	11.0
3	徐金会	曲阜师范大学生命科学学院	40	116	7.0	9.0
4	郑莹莹	曲阜师范大学生命科学学院	3	4	1.0	2.0
5	陈蕾	曲阜师范大学生命科学学院	6	19	3.0	4.0