大白菜InDel-PCR反应体系的优化

• 作者: 原玉香 姚秋菊 张强 张晓伟 梁爽 田保明 蒋武生 薛银鸽 赵艳艳
• 来源期刊: 河南农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大白菜 InDel PCR 条件优化
• 年，卷（期）: 2012,（9）
• 所属期刊栏目: 园艺·林学
• 页码范围: 110-113
• 页数: 4页
• 分类号: S634.1
• 字数: 3012字
• 语种: 中文

摘要

采用CTAB法提取大白菜基因组DNA,利用单因素试验对InDel - PCR反应体系中的dNTPs浓度、Mg2+浓度、Taq DNA聚合酶用量、模板DNA用量、引物浓度、退火温度、三温循环时间等7个因素进行筛选和优化.结果表明,适用于大白菜InDel - PCR分析的最佳扩增条件为(20μL):dNTPs 0.1 mmol/L、Mg2+ 1.5 mmol/L、Taq DNA聚合酶0.4U、模板DNA 105 ng、引物浓度0.4 μmol/L、退火温度50℃、三温循环时间30s-30s-45 s.该体系可用于大白菜遗传多样性分析及遗传图谱构建.