缢蛏ScHsc70cDNA的分子特性和表达分析

• 作者: 冯冰冰 李家乐 林国文 牛东红 钟玉民 陈慧
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 缢蛏 热休克蛋白70 序列分析 基因表达
• 年，卷（期）: 2012,（1）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 33-44
• 分类号: S917
• 字数: 6071字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2012.00033

摘要

从缢蛏(Sinonovacula constricta Lamarck) cDNA文库中筛选出一条热休克蛋白70(Heat shock protein 70,HSP70)同源序列,采用EST扩增和5′RACE(rapid amplification of cDNA ends,RACE)扩增方法获得全长cDNA序列,共2 335 bp,包括76 bp的5′非翻译区和309 bp的3′非翻译区,以及1 950 bp的开放阅读框.阅读框共编码649个氨基酸,推算的分子量约为70.89 kD,理论等电点为5.28.氨基酸序列分析结果表明,该基因的氨基酸序列含有HSP70家族的3个签名序列,2个糖基化位点,1个ATP-GTP结合位点,且C末端具有GGXP四肽重复序列以及细胞质特异性调控基序EEVD.该基因是组成型HSC70(Heat shock cognate 70)亚家族基因成员,被命名为ScHsc 70.基于氨基酸序列的双壳贝类聚类分析表明,缢蛏与南极帽贝(Laternula elliptica)、文蛤(Meretrix meretrix)的亲缘关系最近.荧光定量表达分析显示,ScHsc70 mRNA在缢蛏水管、鳃、斧足、外套膜、肝和性腺等组织中以不同水平存在,其中在外套膜中的表达量最低,而在水管和肝中的表达量最高.经副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)和副鳗弧菌(V.anguillarum)诱导后,ScHsc70 mRNA在缢蛏肝中的水平呈现先升高后下降的变化趋势,且分别在感染后的第20小时和第30小时达到最高.结果提示,缢蛏Sc Hsc 70基因可能参与了对细菌感染的防御反应.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林国文		18	175	8.0	12.0
2	陈慧		21	188	9.0	13.0
3	冯冰冰	上海海洋大学水产与生命学院农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室	10	128	6.0	10.0
4	牛东红	上海海洋大学水产与生命学院农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室	27	216	10.0	14.0
5	钟玉民	上海海洋大学水产与生命学院农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室	4	33	3.0	4.0