NBS1基因SNPs与中国汉族人群原发性肝癌的遗传易感性

• 作者: 张俊霞 张蓓 李倩 王岩 赵艳平 黄坚
• 来源期刊: 生物化学与生物物理进展
• 学科: 医学
• 关键词: 高分辨率SSCP分析 NBS1 单核苷酸多态性 原发性肝癌 遗传易感性
• 年，卷（期）: 2012,（7）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 678-686
• 页数: 9页
• 分类号: Q75|R73
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1206.2011.00536

摘要

为分析DNA损伤修复相关基因NBS1单核苷酸多态性(SNPs)与原发性肝癌遗传易感性的关系,并对高分辨率单链构象多态性(SSCP)检测技术在SNPs分型中的适用性进行评估,本研究对来自中国汉族人群的327例原发性肝癌以及295例阴性对照中NBS1基因常见SNPs的稀有等位基因频率进行检测和分析.此外,对NBS1基因6个常见SNPs分别选择部分样本同时进行直接序列测定,以比较2种方法的检测效果.119例原发性肝癌以及95例肝硬化/慢性肝炎组织标本的SSCP分析结果表明,6个常见NBS1基因SNPs位点(102G＞A,320+208G/A,553G＞C,1197T＞C,2016A＞G和2071-30A＞T)中,SNP 1197T＞C的稀有等位基因频率为68.1％,显著高于肝硬化/慢性肝炎对照的57.9％(P=0.0298).对该SNP位点另外采用208份肝细胞癌和200份健康人群血液标本进一步分析,肝细胞癌SNP 1197T＞C的稀有等位基因频率为66.8％,显著高于健康人群对照的58.8％(P=0.0170).其他5个SNPs的稀有等位基因频率在原发性肝癌与肝硬化/慢性肝炎之间均无显著性差异.高分辨率SSCP分析法与直接序列测定法对所选样本的SNPs基因分型结果完全一致,而且直接测序法对PCR扩增产物质量的要求相对高分辨率SSCP分析更高.研究表明,中国汉族人群NBS1基因SNP 1197T＞C可能与原发性肝癌的发生相关,高分辨率SSCP技术准确度与直接测序法相当,且操作更加简便易行,非常适用于大量样本多个已知SNPs的基因分型.