应用微卫星DNA标记探讨我国长江中下游地区湖北钉螺群体遗传结构

• 作者: 刘琴 吕山 周晓农 张丽 李石柱 杨坤 王强 钱颖骏
• 来源期刊: 中国寄生虫学与寄生虫病杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 湖北钉螺 微卫星DNA 群体遗传差异
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 268-273
• 分类号: R383.241
• 语种: 中文

摘要

目的 应用微卫星DNA分子标志分析中国长江中下游地区湖北钉螺群体的遗传结构. 方法 利用6对微卫星DNA引物,对采集自湖沼型血吸虫病流行区的湖南汉寿县、湖北阳新县、江西星子县、安徽当涂县和江苏扬州邗江区的湖北钉螺的P84、T5-13、T5-11、T4-22、T6-27和P82等6个位点进行荧光标记通用引物PCR扩增.每个采集点采集20～50个钉螺标本,共165个.统计分析各群体的等位基因数(Na)、近交系数(FIS)、期望杂合度(He)、观察杂合度(Ho)、多态信息含量(PIC)、群体间的遗传分化系数(FST)和遗传距离,根据遗传距离进行聚类分析,并进行分子变异方差分析(AMOVA). 结果 5个湖北钉螺群体在6个微卫星位点等位基因数范围为3～33,平均为15.833.群体的平均He和Ho范围分别为0.600～0.883和0.308～0.759,两者在湖北群体最高,在江苏群体最低.群体的FIS范围为0.143～0.539.成对群体间的FST范围为0.0006～0.0531,由于FST值较小,提示群体间未出现明显遗传分化.各群体的平均PIC为0.511～0.850,除江苏群体外,均为高度多态.分级AMOVA结算结果显示,变异主要存在于个体间,占总变异的95.2％.聚类分析结果显示,安徽群体与江苏群体首先聚为一支,然后依次同湖南、江西、湖北群体聚在一起. 结论 湖北钉螺多样性较为丰富;聚类分析结果符合湖北钉螺的地理分布格局；5个群体之间遗传差异较小,微卫星DNA的变异主要存在个体间.