蝴蝶兰EST资源SSR标记分析与开发

• 作者: 张水明 汪天 陈程 龚凌燕
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 蝴蝶兰 EST-SSR 分子标记
• 年，卷（期）: 2012,（6）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1191-1198
• 分类号: S682.31
• 语种: 中文

摘要

利用SSRIT软件对NCBI上蝴蝶兰的8188条EST序列按照碱基重复单元数8以上的标准进行SSR位点查找，发掘出246条EST序列，共含有261个SSR位点，检出率为3．19％。二核苷酸重复是最主要的重复类型，占SSR总数的94．25％。SSR的不同重复单元中，最常见的重复单元是：（TA）n和（GA）n，其余出现频率较高的依次为（TC）n、（AT）n和（AG）n。设计了32对EST-SSR引物，以蝴蝶兰品种‘V31’的DNA为模板进行PCR扩增，发现16对引物能扩增出预期产物。进一步用这16对引物对16个蝴蝶兰品种（系）进行PCR扩增，9对引物有多态性，多态性条带数在2-12个之间。结果表明，设计开发的蝴蝶兰的ESToSSR标记是有效的。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	汪天	安徽农业大学园艺学院	43	793	15.0	27.0
2	张水明	安徽农业大学园艺学院	44	390	12.0	18.0
3	陈程	安徽农业大学园艺学院	7	62	5.0	7.0
4	龚凌燕	安徽农业大学园艺学院	6	60	4.0	6.0