斑节对虾抗菌肽Penaeidin基因的克隆及其序列分析

• 作者: 刘志刚 叶松 曾硕果 王亚龙 赵若聪 邬玉兰 高安健
• 来源期刊: 热带医学杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: 斑节对虾 抗菌肽 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2012,（12）
• 所属期刊栏目: 实验研究论著
• 页码范围: 1444-1447
• 分类号: Q516
• 语种: 中文

摘要

目的 克隆斑节对虾Penaeidin抗菌肽基因,构建克隆载体,测序后进行序列分析.方法 从斑节对虾采集血淋巴后提取总RNA,经反转录得到eDNA,用特异性引物进行PCR扩增得到具有双酶切位点的重组Penaeidin目的基因片段.将其连接至PMD18-T载体,转化至Top10克隆菌进行克隆并测序,用生物信息学软件进行序列分析.结果 测序结果表明斑节对虾Penaeidin抗菌肽基因全长225 bp,编码74个氨基酸.将克隆所得的斑节对虾Penaeidin基因序列与NCBI数据库中的斑节对虾Penaeidin基因(FJ686016,AF475082)同源性为100％,与其它物种虾的Penaeidin基因同源性为48％～92％.分子进化树显示斑节对虾Penaeidin抗菌肽和印度对虾Penaeidin抗菌肽聚为一大枝,而圣保罗对虾、小褐美对虾、巴西美对虾、白滨对虾Penaeidin聚为一大枝,南方滨对虾Penaeidin则自成一枝.二级结构预测表明本次克隆得到的斑节对虾Penaeidin信号肽区为β折叠片,成熟肽主要为β折叠片和转角结构.成熟肽的N端和C端亲水性较强,N端为柔性区域.其中氨基酸序列30-40和60-70表现为潜在的T细胞抗原表位.结论 成功克隆出斑节对虾Penaeidin基因,对其序列的分析结果将为后续的蛋白表达、工业化生产和理论研究奠定前期基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邬玉兰	深圳大学医学院过敏反应与免疫学研究所	36	133	6.0	8.0
2	刘志刚	深圳大学医学院过敏反应与免疫学研究所	324	1724	17.0	23.0
3	高安健	深圳大学医学院过敏反应与免疫学研究所	3	4	1.0	1.0
4	赵若聪	深圳大学生命科学学院	3	23	2.0	3.0
5	叶松	深圳大学生命科学学院	1	2	1.0	1.0
6	曾硕果	深圳大学医学院过敏反应与免疫学研究所	1	2	1.0	1.0
7	王亚龙	深圳大学生命科学学院	1	2	1.0	1.0