艾滋病毒蛋白酶异位抑制剂体系的分子动力学研究

• 作者: 孙德福 张少龙 张庆刚 张怿慈 王加磊
• 来源期刊: 山东科学
• 学科: 化学
• 关键词: MM—PBSA 结合自由能 HIV-1蛋白酶 分子片段 异位抑制剂
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 页码范围: 20-25,29
• 页数: 7页
• 分类号: O641.12
• 字数: 3107字
• 语种: 中文

摘要

对艾滋病毒蛋白酶异位抑制剂体系和活性位抑制剂体系进行8ns的分子动力学模拟，用MM—PBSA方法分别计算了抑制剂与蛋白酶的结合自由能。异位抑制剂体系中抑制剂与蛋白酶的结合自由能为-90．30kcal／mol，活性位抑制剂体系中为-59．58kcal／mol。在异位抑制剂体系中分子片段4DX卡在蛋白酶的exo位，使蛋白酶活性位点附近残基的活动范围减小，有利于抑制剂被束缚在活性位点附近。异位抑制剂使体系刚性更强，更稳定，抑制剂与蛋白酶的结合更为牢固。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张庆刚	山东师范大学物理与电子科学学院	71	240	8.0	11.0
2	张少龙	山东师范大学物理与电子科学学院	29	118	6.0	9.0
3	王加磊	山东师范大学物理与电子科学学院	3	8	2.0	2.0
4	张怿慈	山东师范大学物理与电子科学学院	12	35	3.0	5.0
5	孙德福	山东师范大学物理与电子科学学院	2	7	2.0	2.0