大豆脂肪酸Fad3a基因HRM检测体系优化研究

• 作者: 孙梦阳 李文滨 武林 滕卫丽 王艳 赵雪 韩英鹏
• 来源期刊: 大豆科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 Fad3a SNP HRM体系优化
• 年，卷（期）: 2012,（6）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 882-886
• 页数: 5页
• 分类号: S565.1
• 字数: 2284字
• 语种: 中文

摘要

高分辨率熔解曲线分析法可准确检测单核苷酸多态性,具有稳定性和高效性的特点.建立基于HRM的SNP检测方法,确立最佳的反应体系和反应条件是后续基因分型研究的前提和基础.Fad3a基因为大豆脂肪酸合成的关键酶基因,以Fad3a基因为研究对象,通过测序获得大豆品种合丰25(亚麻酸含量5.94％)和L-5(亚麻酸含量2.75％)在Fad3a基因序列上的单核苷酸多态性位点,根据这2个品种的Fad3a基因测序结果,利用Lighter scanner primer design软件设计产物长度不同的SNP突变引物5对,探索PCR产物长度和不同的退火温度对HRM分型结果的影响.结果表明:HRM分型的扩增子适宜长度应小于150 bp,且在扩增成功的基础上使用相对较高的退火温度可使待测PCR产物熔解峰单一,熔解曲线平稳.