大豆基因组GmGAI同源基因的生物信息学分析

• 作者: 卢清瑶 宋仙萍 张彦威 李文滨 谷月娇 赵琳
• 来源期刊: 大豆科学
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 GAI基因 DELLA结构域 GRAS结构域
• 年，卷（期）: 2012,（6）
• 所属期刊栏目: 遗传育种·分子生物学
• 页码范围: 869-873,877
• 页数: 6页
• 分类号: S565.1
• 字数: 3427字
• 语种: 中文

摘要

利用Phytozome数据库、NCBI站和MEGA4.0、ClustalX软件对大豆(Glycine max)基因组中GAI(GA insensitive)同源基因进行生物信息学分析,发现大豆GAI基因有7个拷贝,都不含有内含子,分别分布于第4、5、6、8、10、11和18号染色体上,它们都属于GRAS家族,都存在DELLA (34-106)和GRAS(158-513)2个结构域.氨基酸序列比对和系统进化树分析表明,大豆GAI的7个拷贝进化距离并不是最近的,而是分别有与之最近的其他物种,推测大豆GAI的7个拷贝在进化的过程中功能上发生了一些变化,对植物的生长发育可能会产生不同的影响.