一株鸭源H4N6亚型禽流感病毒A/duck/Shanghai/Y20/2006的全基因组序列测定及遗传演化分析

• 作者: 刘佩红 刘健 周锦萍 杨德全 王建 葛菲菲 鞠厚斌
• 来源期刊: 江苏农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鸭源禽流感病毒 H4N6亚型 全基因组序列 遗传演化分析 基因重组
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 所属期刊栏目: 畜牧兽医·水产养殖
• 页码范围: 815-822
• 分类号: S858.322.65
• 字数: 6352字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-4440.2012.04.024

摘要

为了解鸭源H4N6亚型禽流感病毒A/duck/Shanghai/Y20/2006( DK/SH/Y20/06)的来源、特征及其分子演化规律,进一步丰富水禽流感病毒的基因库,对该病毒8个基因片段分别进行了扩增和序列测定,利用分子生物学软件对测序结果进行序列分析,并与GenBank登录的相关病毒进行了遗传演化分析.结果表明,DK/SH/Y20/06的HA基因切割位点附近的氨基酸序列(PEKASR ↓ GLF)符合低致病力AIV的特征,其分子遗传演化关系属于欧亚分支；NA基因与A/mallard/Yanchen/2005( H4N6)在同一分支内,核苷酸序列同源性为98.3％；而PB2、PB1、NP、PA基因与目前在国内流行的H6亚型禽流感病毒关系密切；M基因与A/environment/Korea/CSM05/2004( H3N1)处于同一分支；而NS基因与A/wild duck/Korea/YS44/2004( H1N2)同源性最高.且DK/SH/Y20/06的8个基因与美洲H4N6亚型AIV分离株均不处在同一遗传进化分支上,相互之间遗传关系较远.可见,DK/SH/Y20/06可能是由H4N6、H6N2、H6N5、H3N1和H1N2等不同亚型来源的基因在鸭体内经过复杂重组演变的一株重组病毒.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘佩红		69	286	9.0	12.0
2	刘健		52	184	7.0	11.0
3	周锦萍		89	317	10.0	13.0
4	鞠厚斌		64	242	9.0	12.0
5	杨德全		48	164	7.0	10.0
6	葛菲菲		53	203	8.0	12.0
7	王建		97	386	10.0	15.0