多主棒孢菌调控致病性相关基因CCK1的克隆及生物信息学分析

• 作者: 刘晓妹 张欣 张贺 漆艳香 蒲金基 谢艺贤 郑服丛
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 多主棒孢菌 蛋白激酶 克隆 生物学信息
• 年，卷（期）: 2012,（10）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 168-172
• 页数: 5页
• 字数: 4507字
• 语种: 中文

摘要

采用同源克隆、SEFA-PCR和RT-PCR技术克隆获得了多主棒孢菌(Corynespora cassiicola)CCK1基因的DNA和cDNA.生物信息学分析表明,该基因DNA和cDNA全长分别为2 710 bp和1 065 bp,编码区含4个内含子(长53、54、50和56bp),推测编码354个氨基酸,其分子量约40.98 kD,等电点(pI) 6.43.从GenBank搜索相似蛋白和构建进化树发现,CCK1与多个丝状真菌调控致病性相关的PMK1类MAPK蛋白聚为一类,且含1个参与双重磷酸化作用的MAPK蛋白激活域TEY和1个Ser/Thr蛋白激酶保守结构域.推测CCK1基因可能参与调控C.cassiicola菌丝生长、产孢和致病性等.