稀有白甲鱼西江种群mtDNA D环区的结构及遗传多样性

• 作者: 代应贵 冉光鑫 岳晓炯
• 来源期刊: 上海海洋大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 稀有白甲鱼 mtDNA D环 遗传多样性 西江
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 水产生物技术
• 页码范围: 176-182
• 分类号: S917
• 字数: 5584字
• 语种: 中文

摘要

采用PCR扩增和DNA直接测序技术,测定分析了采自珠江水系西江的30尾稀有白甲鱼（Onychostoma rara）mtDNA D环约467 bp的序列。结果显示,该序列的长度为467～470 bp,共计发现了16个变异位点,占分析总位点数的3.40%,其碱基组成A＋T的平均含量（67.6%）高于C＋T（32.3%）。稀有白甲鱼西江种群mtDNA D环区在结构上可分为终止序列区、中央保守区和保守序列区,存在着与终止相关的序列ETAS以及保守序列CSB-F、CSB-E、CSB-D和CSB1。定义了11种单倍型,单倍型多样性指数（Hd）为0.733 3,单倍型之间平均遗传距离（P）为0.010 2,核苷酸多样性（Pi）为0.005 79,平均核苷酸差异数（K）为2.705 75。11个单倍型构建的非加权分组平均法（UPGMA）系统树聚为2个分支。该研究表明稀有白甲鱼西江种群存在着较丰富的遗传多样性。研究亮点：（1）有关濒危鱼类稀有白甲鱼西江种群mtDNA D环测序及遗传多样性研究尚未见报道;（2）本研究揭示了稀有白甲鱼西江种群尚保存有较丰富的遗传多样性;（3）对稀有白甲鱼西江种群遗传学研究具有理论价值,并对开展该种群的保护和资源利用具有现实指导意义。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	代应贵	贵州大学动物科学学院	45	462	13.0	19.0
2	冉光鑫	贵州大学动物科学学院	6	23	3.0	4.0
3	岳晓炯	贵州大学动物科学学院	6	27	3.0	5.0