应用T载体连接PCR技术分离黄嘴白鹭微卫星位点

• 作者: 周晓平 方文珍 陈小麟 黄勋和
• 来源期刊: 厦门大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 微卫星分离 T载体连接PCR 黄嘴白鹭
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 280-285
• 分类号: Q953|Q959.7
• 字数: 2837字
• 语种: 中文

摘要

传统的微卫星分离策略对于低丰度的物种如鸟类而言,通常是低效的.探讨了一种改良的T载体PCR序列获取法用于黄嘴白鹭(Egretta eulophotes)微卫星DNA的分离,称为T载体连接PCR(T-vector-ligation PCR,TVL-PCR).在获取第一侧微卫星序列的71个阳性克隆中,59个克隆含有重复序列,设计了48对位点特异巢式引物.经过两轮TVL-PCR后,31个位点的扩增产物为预期大小,经测序后获得21个完整的微卫星位点.除去侧翼序列过短和小卫星位点外,设计16个微卫星位点进行多态信息检测,其中7个位点显示出多态性,平均等位基因数为2～20,观察杂合度(HO)和期望杂合度(HE)分别为0.375～0.958和0.477～0.956,所有位点都符合哈迪-温伯格平衡(HWE)和连锁平衡.说明TVL-PCR技术对低丰度微卫星物种的位点分离具有一定的应用价值.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周晓平	厦门大学生命科学学院滨海湿地生态系统教育部重点实验室	11	90	4.0	9.0
2	陈小麟	厦门大学生命科学学院滨海湿地生态系统教育部重点实验室	53	684	17.0	22.0
3	方文珍	厦门大学生命科学学院滨海湿地生态系统教育部重点实验室	25	300	11.0	16.0
4	黄勋和	厦门大学生命科学学院滨海湿地生态系统教育部重点实验室	2	15	2.0	2.0