穿心莲ent-柯巴基焦磷酸合酶基因的克隆与生物信息学分析

• 作者: 何瑞 姚攀 徐晖 李竹君 杨锦芬 陈慧芝
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 穿心莲 穿心莲内酯 ent-焦磷酸古巴酯合成酶(CPS) 基因克隆
• 年，卷（期）: 2012,（10）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 156-162
• 页数: 7页
• 字数: 4749字
• 语种: 中文

摘要

旨在克隆穿心莲CPS的编码基因,并进行序列分析.通过RT-PCR和cDNA末端快速扩增的技术从穿心莲叶片中获得目的基因；并利用生物信息学的方法对其编码蛋白进行功能分析.结果显示,获得了全长2 499 bp的cDNA序列,编码一个833aa的蛋白.序列同源性比较表明,该蛋白与野甘草、咖啡等其他植物来源的CPS具有较高的同源性.保守功能结构域分析显示,该蛋白包含一个富含Asp残基的植物萜类合酶的共有保守功能域“DXDD”,归属于萜类生物合成酶Ⅰ类超级家族和顺式聚异戊二烯焦磷酸合酶超级家族.初步推测克隆得到了穿心莲CPS的编码基因(命名为ApCPS,GenBank登录号为JN216843.1).