红原鸡全基因组中微卫星分布规律研究

• 作者: 岳碧松 张修月 李午佼 李玉芝 杜联明 黄杰
• 来源期刊: 四川动物
• 学科: 生物学
• 关键词: 红原鸡 基因组 微卫星
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 358-363
• 分类号: Q959.7|Q343
• 字数: 5511字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-7083.2012.03.005

摘要

本文对红原鸡Gallus gallus全基因组中微卫星数量及分布规律进行了分析,查找到1～6个碱基重复类型的微卫星序列共282 728个,约占全基因组序列(1.1 Gb)的0.49％,分布频率为1/3.89 kb,微卫星序列的长度主要在12 ～ 70个碱基长度范围内.第1、2、3条染色体上微卫星分布频率较高,而32号染色体上无微卫星分布.不同类型微卫星中,单碱基重复类型数目最多,为184 192个,占总数的65.1％；其次是四、二、三、五、六碱基重复单元序列,分别占到总数的12.8％、9.7％、7.2％、4.6％、0.8％.T、A、AT、GTTT、AAAC、G、C、ATTT、AC、GT、AAAT、ATT、AAC、AAT、GTT、AG、CT、CTTI、AAAG、GTTTT、AAACA、AAGG、CCTT是红原鸡基因组中最主要的微卫星重复类型.本研究为红原鸡微卫星标记的分离筛选、遗传多样性的研究以及不同物种微卫星的比较分析奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张修月	四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室四川大学生命科学学院	5	70	4.0	5.0
2	黄杰	四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室四川大学生命科学学院	2	30	2.0	2.0
3	杜联明	四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室四川大学生命科学学院	2	30	2.0	2.0
4	李玉芝	四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室四川大学生命科学学院	1	20	1.0	1.0
5	李午佼	四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室四川大学生命科学学院	2	30	2.0	2.0