藏酋猴达菲抗原/趋化因子受体基因的克隆与序列分析

• 作者: 刘伟 司晓辉 周亮 姚永芳 张栓玲 徐怀亮
• 来源期刊: 四川动物
• 学科: 生物学
• 关键词: 藏酋猴 FY基因 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 所属期刊栏目: 基础资料
• 页码范围: 574-579
• 分类号: Q959.8|Q78
• 字数: 4884字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-7083.2012.04.012

摘要

利用GenBank公布的恒河猴达菲抗原/趋化因子受体基因(FY)核苷酸序列设计2对特异引物,采用PCR方法克隆藏酋猴Macaca thibetana FY基因,分别得到1.0 kb和1.1 kb的DNA片段,通过DNA测序和序列拼接获得藏酋猴FY基因1491 bp片段,该片段包含2个外显子(21 bp和990 bp)和1个内含子(480 bp).该基因开放阅读框长1011 bp,编码336个氨基酸,该蛋白等电点是5.77,分子量是35.52 kDa,分子半衰期30 h,不稳定指数是39.84,总平均疏水性是0.689,是疏水性蛋白.拓扑结构预测显示该基因编码氨基酸有15个潜在的功能位点:3个N-糖基化位点,2个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,10个N-肉豆蔻酰化位点.整个蛋白质多肽链含有7个跨膜螺旋区,4个细胞外区和4个细胞内区.同源性比较结果显示,与人、恒河猴、牛、兔、犬、大熊猫6个物种FY基因编码区核苷酸序列间同源性分别为94.7％、99％、75.2％、80.2％、74.5％、71.7％,氨基酸序列间同源性分别为92％、99％、89.8％、78.2％、90％、89.3％.系统进化树结果表明:藏酋猴与恒河猴亲缘关系最近,与人类亲缘关系较近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘伟	四川农业大学动物科技学院	65	777	17.0	26.0
2	徐怀亮	四川农业大学动物科技学院	23	65	5.0	6.0
3	姚永芳	四川农业大学动物科技学院	20	47	4.0	5.0
4	司晓辉	四川农业大学动物科技学院	5	10	2.0	3.0
5	张栓玲	四川农业大学动物科技学院	2	3	1.0	1.0