栉孔扇贝BES-SSR的开发及遗传多样性分析

• 作者: 常亚青 张晓军 张秀英 李富花 相建海 赵翠 郇聘
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 栉孔扇贝 BAC末端序列 微卫星 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2012,（6）
• 页码范围: 815-824
• 分类号: Q346|S917
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1231.2012.27808

摘要

通过分析栉孔扇贝BAC末端序列,发现大量微卫星DNA;随机选择14个多态性BES-SSR标记,在我国栉孔扇贝大连群体(DL)和青岛群体(QD)中验证标记的可用性,同时对这两个群体的遗传结构及其分化进行研究.结果表明,从17447条BESs中得到微卫星3374个,以四核苷酸重复为主(26.6％),五核苷酸重复次之(17.7％),六核苷酸重复最少(12.0％).BES-SSR引物的扩增效率为77.3％(99/128),在作图亲本中的多态比例为33.6％(43/128),14个基因座在两群体中的平均等位基因数N,分别为18.9286和26.2143,平均有效等位基因数Ne为11.7505和17.0891,平均观察杂合度Ho为0.5100和0.4204,平均期望杂合度He为0.9156和0.9450,多态信息含量PIC分别为0.8940和0.9302,群体遗传多样性水平较高.两群体间的无偏遗传相似性系数为0.4879,遗传距离为0.7177,平均基因分化指数FST为0.0243,基因流Nm为10.0179,显示群体间遗传分化程度较弱,遗传变异主要来自于群体内个体之间,经Hardy-Weinberg平衡检验,两群体普遍存在杂合子缺失现象.研究表明,所开发的BES-SSR是高度多态位点,用于群体遗传多样性分析效果很好,显示BES是微卫星标记开发和应用的重要资源.