利用oligo芯片技术鉴定橡胶树死皮相关基因

• 作者: 刘向红 李德军 覃碧 邓治
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 橡胶树 死皮 oligo芯片 TPD相关基因 RT-PCR
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 生物技术应用
• 页码范围: 296-301
• 分类号: S794.1
• 字数: 5478字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2012.02.017

摘要

橡胶树死皮(Tapping Panel Dryness,TPD)是天然橡胶单产提高的主要限制因子之一,给橡胶种植业带来严重危害.本研究利用定制橡胶树oligo芯片,通过提取死皮和健康橡胶树胶乳总RNA,标记并反转录成cDNA后与橡胶树oligo芯片进行杂交鉴定TPD相关基因,利用RT-PCR技术对芯片结果进行验证.对芯片数据分析结果显示,以2倍标准在死皮与健康橡胶树间筛选到26个差异表达基因,其功能涉及橡胶生物合成、细胞程序性死亡、细胞抗性及防御反应、活性氧代谢、DNA甲基化、泛素-蛋白酶体、信号传导、蛋白质合成、加工及转运等调控途径.进一步的RT-PCR验证结果表明,随机选取12个基因的表达模式均与芯片结果一致.本研究为大规模鉴定TPD相关基因和揭示TPD发生分子机制奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	邓治	中国热带农业科学院橡胶研究所农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室	21	69	5.0	7.0
2	刘向红	中国热带农业科学院橡胶研究所农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室	6	9	2.0	2.0
6	李德军	中国热带农业科学院橡胶研究所农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室	20	42	3.0	6.0
7	覃碧	中国热带农业科学院橡胶研究所农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室	14	33	4.0	5.0