利用EST序列构建Mascot本地数据库

• 作者: 刘海军 陈克平
• 来源期刊: 生命的化学
• 学科: 生物学
• 关键词: 蛋白质组学 EST序列 质谱数据 Mascot
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 新技术·新方法
• 页码范围: 294-298
• 页数: 5页
• 分类号: Q816
• 语种: 中文

摘要

对蛋白质质谱数据进行数据库比对和鉴定是蛋白质组学研究技术中的一个重要步骤.由于公共数据库蛋白质数据信息不全,有些蛋白质质谱数据无法得到有效的鉴定.而利用相关物种的EST序列构建专门的质谱数据库则可以增加鉴定未知蛋白的几率.本文介绍了利用EST序列构建Mascot本地数据库的具体方法和步骤,扩展了Mascot检索引擎对蛋白质质谱数据的鉴定范围,从数据库层面提高了对未知蛋白的鉴别几率,为蛋白质组学研究提供了一种较为实用的生物信息学分析技术.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈克平		102	716	13.0	21.0
2	刘海军		6	21	4.0	4.0