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越橘查耳酮合酶基因的克隆及表达分析
越橘查耳酮合酶基因的克隆及表达分析
作者:
刘海广
吴林
张志东
李亚东
李晓艳
李海燕
裴嘉博
原文服务方:
东北林业大学学报
越橘
查耳酮合酶基因
相对荧光定量PCR
摘要:
为研究越橘花色素苷合成的分子机制,利用RT-PCR和RACE技术从越橘(Vaccinium spp.)果实中克隆了查耳酮合酶基因(CHS)的全长cDNA,命名为VcCHS,GenBank登录号为JN654702.VcCHS全长1438 bp,包含107 bp的5 ′非编码区、71 bp的3′非编码区和1个长度为1 260 bp编码419个氨基酸的开放阅读框.该基因编码的蛋白具有CHS家族普遍存在的功能活性位点:Cys(C)164、His(H)303、Asn(N)336和特征多肽序列(RLMMYQQGCFAGGTVLR).多重比对分析发现越橘VcCHS基因编码的氨基酸序列与葡萄(Vitis vinifera)CHS基因编码的氨基酸序列相似性达90.2%.系统进化分析表明,该序列与杜鹃花目的植物聚为一类.VcCHS基因在果实发育的整个过程均有不同程度的转录表达,花期和果实成熟期表达量较高,绿果期表达量最低.VcCHS相对表达量变化与花色素苷相对含量的变化趋势具有一致性,并均在果皮组织中达到最高.
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文献信息
篇名
越橘查耳酮合酶基因的克隆及表达分析
来源期刊
东北林业大学学报
学科
关键词
越橘
查耳酮合酶基因
相对荧光定量PCR
年,卷(期)
2012,(11)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
60-65
页数
6页
分类号
Q943.2
字数
语种
中文
DOI
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作者信息
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单位
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刘海广
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吴林
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李亚东
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查耳酮合酶基因
相对荧光定量PCR
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
东北林业大学学报
主办单位:
东北林业大学
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-5382
CN:
23-1268/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1957-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
7235
总下载数(次)
0
总被引数(次)
68015
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东北林业大学学报2012年第5期
东北林业大学学报2012年第6期
东北林业大学学报2012年第7期
东北林业大学学报2012年第2期
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东北林业大学学报2012年第11期
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