广西新分离流行性乙型脑炎病毒GP0722株全基因组分子特性研究

• 作者: 杨进业 谢艺红 谭毅 闭福银
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 乙型脑炎病毒 基因 种系发生
• 年，卷（期）: 2012,（3）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 270-273
• 分类号: R373
• 字数: 2441字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2012.03.018

摘要

目的 对广西新分离乙脑病毒GP0722株进行全基因序列测定和分析,了解其基因组结构及毒力特征.方法 应用乙脑病毒全基因组扩增引物进行RT-PCR扩增,PCR产物直接测序,拼接后得到全基因序列.应用Clustal X(1.8)、DNASTAR、Mega 4.1等生物软件进行核苷酸序列及氨基酸序列分析和病毒的系统进化分析.结果 广西新分离乙脑病毒GP0722全基因长10 965个核苷酸,从97到10 395位编码一个开放阅读框,编码3 432个氨基酸,与目前使用的减毒活疫苗株SA-14-14-2株比较,只有88.9%的核苷酸同源性,97.6%的氨基酸同源性,全基因组共存在1 222个核苷酸差异,83个氨基酸差异.与GenBank中选择的21株乙脑病毒全基因序列比较发现,其核苷酸总体差异率为0.9%～18.8%,氨基酸总体差异率为0.1%～5.2%.通过PrM/C区段、E区段、3′NTR区段和全基因序列进行系统进化分析显示该毒株属于基因1型乙脑病毒.结论 新分离的乙脑病毒GP0722株属于基因1型,与JEV/sw/Mie/40/2004进化关系最近,与疫苗株SA-14-14-2相比关键位点氨基酸未见变异,现行使用的疫苗仍能保护GP0722引起的感染.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	谢艺红		53	359	10.0	16.0
2	谭毅		131	911	16.0	23.0
3	杨进业		93	745	16.0	22.0
4	闭福银		53	383	11.0	16.0