一种新的DNA分子标记技术——起始密码子-微卫星扩增多态性

• 作者: 侯小改 刘崇怀 郭大龙 郭明晓
• 来源期刊: 植物生理学报
• 关键词: 分子标记 SC-SSR SCoT ISSR
• 年，卷（期）: 2012,（4）
• 所属期刊栏目: 技术与方法
• 页码范围: 408-412
• 页数: 5页
• 语种: 中文

摘要

综合SCoT和ISSR分子标记技术开发了一种既能将标记位点与表达序列紧密联系,又具有相对较高的多态性的新的分子标记技术——起始密码子-微卫星扩增多态性(start codon-simple sequence repeat,SC-SSR). SC-SSR标记是基于PCR的目的基因标记系统,上游引物用SCoT标记引物,瞄准基因区域,下游引物用ISSR标记引物,上下游引物间可自由组配.引物设计原则同SCoT标记和ISSR标记.使用50℃的退火温度,保证了扩增结果的稳定性.PCR结果采用琼脂糖凝胶电泳和聚丙烯酰胺凝胶电泳检测.SC-SSR分子标记结合了ISSR标记和SCoT标记的优点,具有操作简单、成本低廉、多态性丰富、重复性好、引物设计简单且通用性良好、同时与表达序列紧密连锁等诸多优点,可用于种质资源的鉴定评价、遗传图谱的构建、重要性状基因标记、gDNA与cDNA指纹分析乃至图位克隆等方面.