23株芽孢杆菌16S rRNA基因序列扩增与系统发育分析

• 作者: 周光燕 宋萍 张晓娟 张蓓蓓 王柱 王菊英
• 来源期刊: 食品与发酵科技
• 学科: 工学
• 关键词: 芽孢杆菌 16S rRNA 序列分析 系统发育
• 年，卷（期）: 2012,（2）
• 所属期刊栏目: 应用研究
• 页码范围: 9-12
• 分类号: TQ920.1
• 字数: 2475字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-506X.2012.02-003

摘要

采用16S rRNA基因序列分析对西南菌种站(SICC)收集保藏的23株芽孢杆菌进行复核鉴定,以改良的CTAB 法提取细菌DNA,用通用引物F1、R1对菌株进行16S rRNA扩增,使用Clustal X对序列进行比对分析,并用MEGA 4进行建树分析.鉴定结果表明其中13株与原学名一致,1株与原学名不符,其余9株在绘制的N-J发育树中显示同时与枯草芽孢杆菌(Bacillus subtis)、解淀粉芽孢杆菌(B.amyloliquefaciens)汇聚到一个分支,需要用特异PCR方法进一步核实.