源于栽培种花生的EST-SSR引物对野生花生扩增的多态性

• 作者: 严海燕 任小平 周小静 唐梅 姜慧芳 陈玉宁 黄莉
• 来源期刊: 作物学报
• 关键词: 野生花生 EST-SSR 有效性 聚类分析
• 年，卷（期）: 2012,（7）
• 所属期刊栏目: 作物遗传育种·种质资源·分子遗传学
• 页码范围: 1221-1231
• 分类号: S565.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1006.2012.01221

摘要

以花生属86份野生近缘种和3份栽培种为材料,利用从栽培种花生中开发设计的EST-SSR引物,分析其对野生花生扩增的有效性,探讨EST-SSR引物用于花生资源遗传多样性研究的适用性.随机选取235对EST-SSR引物进行筛选,223对EST-SSR引物均扩增出条带,有效性为94.89％,其中能检测到多态性的53对引物在89份资源中共扩增出238条带,包括206条多态性带.每对引物能扩增出1～12多态性带,平均3.89条,多态性指数为0.044～4.040,平均1.173.统计分析结果表明,89份花生种质材料间的平均相似系数为0.685,变异范围为0.442～0.976,在遗传距离为0.408处,分成2大组9小组,栽培种花生被聚在花生区组中,相同区组的材料基本被聚在一起,A.duranensis与栽培种花生(A.hypogaea L.)的关系较近,聚类结果与花生属的植物学分类基本一致.对含油量和基因型数据相关性分析和t检验发现,POCR437-180/170等6对标记可以作为含油量相关分析标记筛选的后备标记.用这6对标记的引物序列搜索cDNA文库和BLAST库,发现引物POCR437序列对应丙二酸单酰-CoA-ACP转酰酶和酰基载体蛋白的编码基因,这2种蛋白质参与脂肪酸的合成.