应用抑制性差减杂交法筛选植物青枯菌致病相关基因

• 作者: 冯洁 刘蕾 张丽勍 张昊 徐进 许景升
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 关键词: 青枯菌 抑制性差减杂交 Ⅲ型分泌系统效应子 致病性
• 年，卷（期）: 2012,（7）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 745-755
• 页数: 11页
• 字数: 7575字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2012.07.004

摘要

植物青枯菌(Ralstonia solanacearum)致病力分化菌株Po82兼具2号小种和NPB(非香蕉致病)菌株的致病特征.为了研究该菌株致病力分化机理,本实验以Po82为待测菌株,构建了抑制性差减杂交文库.建库质量分析结果表明,具有较高的接头连接以及文库构建效率,插入片段平均长度为300 bp,文库构建质量较好.对文库中随机挑取阳性克隆进行测序,共筛选出44个Po82菌株差异基因.生物信息学分析结果表明,所得差异基因主要涉及新陈代谢、转座酶、膜结构、分泌蛋白、毒力、转录因子以及未知功能等.利用基因敲除技术对其中的c00283基因功能进行了研究,结果表明,该基因在Po82菌株致病过程中起重要作用.半定量RT-PCR结果表明,c00283基因在hrp诱导培养基中的表达情况与hrpB基因一致,初步确定其为Ⅲ型分泌系统效应子.基础生物学实验结果表明,该基因对Po82菌株的生长、生物膜形成及运动性没有影响.青枯菌Po82菌株抑制性差减杂交文库的构建及致病相关基因的功能分析,为后续致病力分化的分子机理研究提供基础材料.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张昊	中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室	58	258	9.0	12.0
2	冯洁	中国农业科学院植物保护研究所	25	282	9.0	16.0
3	徐进	中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室	30	280	8.0	16.0
4	许景升	中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室	20	132	6.0	10.0
5	刘蕾	中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室	24	417	9.0	20.0
6	张丽勍	中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室	3	16	3.0	3.0